Hidup kembali di kapal pesiar setelah Ujian Khusus Pulau sama sekali tidak mulus. Hampir segera setelah mereka kembali, siswa tahun pertama dari Tokyo Metropolitan Advanced Nurturing High School menghadapi ujian khusus lainnya, dengan poin kelas dan individu dipertaruhkan.
Selain aturan yang rumit, lebih banyak masalah yang muncul dalam bentuk Kakeru Ryuuen dan Kei Karuizawa. Marah dengan hasil tes sebelumnya, Ryuuen mati-matian untuk mengalahkan setiap kelas dalam tantangan baru menggunakan cara apa pun yang diperlukan. Sementara itu, Karuizawa, pilar penting dari Kelas D, hampir runtuh karena tekanan masa lalunya.
Panggung sekarang diatur untuk Kiyotaka Ayanokouji untuk sekali lagi — menggunakan sepenuhnya perencanaan, pandangan ke depan, dan manipulasi kejamnya — mengarahkan Kelas D menuju kemenangan saat pasukan musuh yang sangat dekat mencoba menjatuhkannya.
